Okno witrażowe pokazuje początki chrześcijaństwa w Japonii i prześladowania chrześcijan. które były niebywale krwawe i okrutne. Przywołane na witrażach postaci lub sceny egzekucji to jedynie wybrane jedne z wielu. Setki chrześcijan zginęły zbiorowo lub indywidualnie spalonych, ukrzyżowanych lub w wyrafinowany sposób zamęczonych.
Obraz witrażowy środkowy przedstawia męczeństwo chrześcijan w Tokio 400 lat temu.
Obraz witrażowy dolny przedstawia pośród wzgórz sylwetki męczenników. Na pierwszym planie siedzi Adam Arakawa (1614). Siedzący po lewej Leon Saisho z Kagoshima (1608), siedzący po prawej Sishiemon Abutomo, w głębi Genka Gaspar z rodziną (1609), w głębi po prawej męczennicy z Hiroshimy i Yamaguchi -Jintaro Toyama i Motonao Kumagaya, Mondo Joan Hara (1623) z Edo.
Lub przejście bezpośrednie do pozostałych okien:
Okno 1 - Wierzę w Boga Ojca Wszechmogącego (Teofania Imienia Boga),
Okno 2 - Wierzę w Boga, Stworzyciela Nieba i Ziemi i wszystkich Bytów widzialnych i niewidzialnych,
Okno 3 - Wierzę w Jednego Pana Jezusa Chrystusa, Syna Bożego Jednorodzonego /.../ On to dla nas ludzi i dla naszego zbawienia zstąpił z Nieba,
Okno 4 - Imiona drugiej Osoby Trójcy Świętej,
Okno 5 - Wierzę w Jezusa Chrystusa ,
Okno 6 - Wierzę w Jezusa Chrystusa, który narodził się z Maryi Panny i stał się człowiekiem,
Okno 7 - Jezus Chrystus umęczon pod Ponckim Piłatem, ukrzyżowan, umarł i pogrzebion,
Okno 8 - Zstąpił do piekieł, trzeciego dnia Zmartwychwstał ,
Okno 9 - Wstąpił do Niebios, stamtąd przyjdzie sądzić żywych i umarłych,
Okno 10 - Wierzę w Ducha Świętego, Pana i Ożywiciela,
Okno 11 - Wierzę w Święty Kościół Powszechny,
Okno 12 - Wierzę w grzechów odpuszczenie - wyznaję jeden Chrzest na odpuszczenie grzechów,
Okno 13 - Wierzę w ciała zmartwychwstanie i oczekuję wskrzeszenia umarłych,
Okno 14 - Wierzę w żywot wieczny, Amen,
Okno na chórze środkowe - Matka Boża Niepokalana i męczeństwo chrześcijan w Japonii,
Okno na chórze prawe - Męczeństwo chrześcijan w Japonii,
